聚合酶鏈式反應的常見問題：PCR產物的電泳檢測時間一般為48h以內，有些很好于當日電泳檢測，大于48h后帶型不規則甚至消失。假陰性：不出現擴增條帶。PCR反應的關鍵環節有模板核酸的制備，引物的質量與特異性，酶的質量及溴乙錠的使用， PCR循環條件。尋找原因亦應針對上述環節進行分析研究。模板：模板中含有雜蛋白質，模板中含有Taq酶抑制劑，模板中蛋白質沒有消化除凈，特別是染色體中的組蛋白，在提取制備模板時丟失過多，或吸入酚。模板核酸變性不徹底。在酶和引物質量好時，不出現擴增帶，極有可能是標本的消化處理，模板核酸提取過程出了毛病，因而要配制有效而穩定的消化處理液，其程序亦應 固定不宜隨意更改。流聚合酶鏈反應將溶液置于熱梯度下，而不是反復加熱和冷卻聚合酶鏈反應混合物。上海血液PCR檢測技術方案

聚合酶鏈式反應準備：PCR引物設計：PCR反應中有兩條引物，即5′端引物和3′引物。設計引物時以一條DNA單鏈為基準（常以信息鏈為基準），5′端引物與位于待擴增片段5′端上的一小段DNA序列相同；3′端引物與位于待擴增片段3′端的一小段DNA序列互補。引物設計的基本原則：引物長度：15-30bp，常用為20bp左右。引物堿基：G+C含量以40-60%為宜，G+C太少擴增效果不佳，G+C 過多易出現非特異條帶。ATGC很好隨機分布，避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。廈門細胞熒光PCR供應商聚合酶鏈式反應中的DMSO、甘油等，主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結構。

逆轉錄-聚合酶鏈反應的原理是：提取組織或細胞中的總RNA，以其中的mRNA作為模板，采用Oligo（dT）或隨機引物利用逆轉錄酶反轉錄成cDNA。再以cDNA為模板進行PCR擴增，而獲得目的基因或檢測基因表達。完整RNA 的提取和純化，是進行RNA 方面的研究工作，如Nothern雜交、mRNA 分離、RT-PCR、定量PCR、cDNA合成及體外翻譯等的前提。所有ＲＮＡ的提取過程中都有五個關鍵點，即樣品細胞或組織的有效破碎；有效地使白復合體變性；對內源ＲＮＡ酶的有效抑制；有效地將ＲＮＡ從ＤＮＡ和蛋白混合物中分離；對于多糖含量高的樣品還牽涉到多糖雜質的有效除去。但其中很關鍵的是抑制RNA酶活性。RNA 的提取目前階段主要可采用兩種途徑，提取總核酸，再用氯化鋰將RNA 沉淀出來；直接在酸性條件下抽提，酸性下DNA與蛋白質進入有機相而RNA 留在水相。種提取方法將導致小分子量RNA 的丟失，目前該方法的使用頻率已很低。

聚合酶鏈反應：在檢測病原體方面,病原體培養是臨床診斷的金標準 .但是對于一些苛養菌 生長緩慢的細菌或難以培養的病原體等培養的陽性檢出率不高.檢測時間過長 無法滿足臨床早期快速診斷以指導醫治的需要[3]。當前 PCR 技術是在傳統 PCR 技術應用的基礎上進行的改進，包括實時定量 PCR 技術 、 實時熒光定量PCR、 PCR-酶聯免疫吸附試驗 、 巢式PCR等。 在PCR技術的輔助作用下，實驗室檢測也逐漸從生化免疫診斷過渡到基因診斷，生化免疫檢測主要從表型表現評估病癥，而基因診斷則深入本質探究其病因，以PCR 技術為主的核酸技術在臨床實驗室檢測與疾病診斷中表現出了明顯的應用價值，在未來的臨床醫學檢驗中必將會得到更加較廣的應用。逆轉錄酶將核糖核酸逆轉錄成cDNA ，然后通過聚合酶鏈反應進行擴增。

聚合酶鏈式反應：模板的制備，PCR的模板可以是DNA，也可以是RNA。模板的取材主要依據PCR的擴增對象，可以是病原體標本如病毒、細菌、菌類等。也可以是病理生理標本如細胞、血液、羊水細胞等。法醫學標本有血斑、精斑、毛發等。標本處理的基本要求是除去雜質，并部分純化標本中的核酸。多數樣品需要經過SDS和蛋白酶K處理。難以破碎的細菌，可用溶菌酶加EDTA處理。所得到的粗制DNA，經酚、氯仿抽提純化，再用乙醇沉淀后用作PCR反應模板。PCR產物的生成量是以指數方式增加的，能將皮克量級的起始待測模板擴增到微克水平。溫州血液Real-time PCR研究方案

現在有些PCR因為擴增區很短，即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內復制完成。上海血液PCR檢測技術方案

聚合酶鏈反應：等位基因特異性聚合酶鏈反應:基于單核苷酸變異的診斷或克隆技術(snv不要與 SNPs 混淆)(患者的單堿基差異)。它需要事先知道DNA序列，包括等位基因之間的差異，并使用3’端包含SNV的引物(通常包含SNV周圍的堿基對緩沖液)。在模板和引物不匹配的情況下，嚴格條件下的PCR擴增效率要低得多，因此用單核苷酸多態性特異性引物成功擴增表明序列中存在特異性單核苷酸多態性。有關更多信息，請參見單核苷酸多態性基因分型。裝配聚合酶鏈反應或者聚合酶循環組件:通過對具有短重疊片段的長寡核苷酸池進行PCR來人工合成長DNA序列。寡核苷酸在有義和反義方向之間交替，重疊片段決定聚合酶鏈反應片段的順序，從而選擇性地產生很終的長DNA產物。上海血液PCR檢測技術方案

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