全基因組甲基化測序（WholeGenomeBisulfiteSequencing,WGBS）是將重亞硫酸鹽Bisulfite處理和高通量測序技術相結合，對有參考基因組進行全基因組范圍的單堿基分辨率的甲基化測序，是DNA甲基化檢測的“金標準”。WGBS滿足全基因組DNA甲基化圖譜及疾病關聯分析、基因調控分析、疾病的甲基化標志物篩選等探索性課題的研究。技術優勢DNA甲基化檢測**有力的工具單堿基分辨率，檢測每個C堿基的甲基化狀態全基因組范圍，**限度地獲得甲基化信息適合所有有參考基因組的物種適合各種類型的樣本樣本要求：基因組DNA:>=3ug；樣品濃度>30ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150；測序深度：>=30X信息分析基于全基因組范圍的甲基化分析，數據質控，5mCCalling，5mC在基因組、染色體、功能元件上的分布，多樣本甲基化差異聚類，差異甲基化DMR鑒定及相關基因的功能分析，結合項目背景和科學問題的數據亮點挖掘。 WGBS用于人、哺乳動物及農林牧漁方向的高水平甲基化研究。北京850K芯片技術服務怎么樣

    亞硫酸鹽結合測序是DNA甲基化檢測的“金標準”方案。除了全基因組甲基化測序等研究手段，對于目標基因/位點檢測或者轉化醫學應用研究來說，需要靈活的靶向甲基化測序方案。BSP(BisulfiteSequencingPCR)結合高通量測序的TargetBisulfiteSequencing滿足幾個到上百個基因/位點的驗證需求,具有高通量、低成本的優勢,***用于臨床大樣本多位點的甲基化biomarker篩選及高水平文章甲基化驗證環節。微生物定植對腸道免疫和代謝相關基因DNA甲基化的影響——團隊成員發表.(IF=)我們以早產幼豬為模型，利用RRBS測序比較正常(n=7)和口服***(n=7)的腸道DNA甲基化差異，發現與先天免疫應答、吞噬和代謝等相關基因的DNA甲基化和表達存在***的差異，并通過高通量BSP測序對EGFL7、LBP8、PTPRE差異甲基化基因進行了驗證。 北京850K芯片技術服務怎么樣云生物提供測序服務。

發育基因的表觀突變是養殖歐洲鱸魚開始馴化的基礎

Epimutations in developmental

genes underlie the onset of domestication in farmed European sea bass. Mol Biol Evol. 2019 May 30 (IF= 14.797)

本研究通過RRBS測序，比較了早期馴化的

(n=12)與野生的(n=12)

歐洲鱸魚在馴化過程中DNA甲基化變化，發現早期馴化的鱸魚與野生的沒有遺傳差異，但在不同胚胎起源的組織中發生DNA甲基化變化。這些甲基化突變與經過25年選擇性育種后的胞嘧啶至胸腺嘧啶多態性***重疊，表觀突變基因與正選擇基因一致。結果表明馴化初始階的表觀變異是一個重要事件。

    芯片平臺作為目前比較成熟的篩選工具，已經在很多領域有了相應的應用。多家芯片公司在DNA甲基化這塊兒有了相應的產品提供，其中應用**為***的就Agilent平臺和Illumina平臺，相應的產品包括AgilentHumanCpGIslandMicroarrayKit，InfiniumHumanMethylation27BeadChip和InfiniumHumanMethylation450KBeadChip。另外RocheNimbleGen和Affymetrix也有相應的芯片推出，但是NimbleGen的芯片今年下半年已經停產。不同的芯片平臺，各自的實驗過程也是不一樣的。安捷倫前期采用的甲基化DNA免疫共沉淀（MeDIP）技術。將基因組DNA分成兩份，一份用來做MeDIP，另一份作為對照。兩個樣品都標記熒光(富集的樣品用Cy5標記，對照用Cy3標記)，然后與芯片雜交。芯片上每個探針的Cy5/Cy3強度比例顯示出該區域的甲基化程度。 焦磷酸測序技術是甲基化檢測新的金標準。

    MethylationEPICBEadChip兼具***的覆蓋范圍和高通量功能，因此是EWAS的理想之選。其他優勢包括：***的全基因組覆蓋范圍(>850,000個甲基化位點)CpG島非CpG和差異甲基化位點FANTOM5增強子ENCODE染色質ENCODE轉錄因子結合位點miRNA啟動子區域實驗分析方法重現性98%（針對技術性重復）98%（針對傳統HumanMethylation450K芯片對照，MethylationEPIC芯片采用的相同樣本）>90%（針對HumanMethylation450K位點內容）用戶友好的簡化工作流程與FFPE樣本兼容MethylationEPICBeadChip遵循用戶友好的簡化的工作流程，可以從低樣本起始量（低至250ng）同時處理多達96個樣本該甲基化芯片針對常規樣本和FFPE樣本提供單CpG位點級別的定量測量，因此能實現超級精細的解析度，方便用戶了解表觀遺傳的變化。 ATAC-seq實驗過程短，從實驗到分析可達2周。北京RIP-seq技術服務怎么樣

通過甲基化數據，篩選疾病耐藥的差異甲基化。北京850K芯片技術服務怎么樣

    甲基化DNA免疫沉淀測序（MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing，MeDIP-Seq）是通過5mC特異性抗體富集甲基化的DN**段，然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的數據量，快速、高效地尋找甲基化區域。可廣泛應用于甲基化與疾病關系研究。技術優勢全基因組范圍鑒定甲基化修飾區域針對性檢測基因組內具有甲基化修飾的區域與WGBS技術相比，成本更低科學方案設計從項目背景了解、協助方案設計、實驗材料選取、建庫測序，到數據分析每個項目有特定的科學問題；需要專業、有價值的建議；科學、縝密的設計及時高效的溝通；以保障高質量研究成果樣本要求：基因組DNA:>=3ug；樣品濃度>50ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150。 北京850K芯片技術服務怎么樣