RIP實驗步驟通常包括:
1. 細胞收集與交聯:培養細胞至適當密度。使用交聯劑(如甲醛)進行交聯,以固定蛋白質-RNA復合物。
2. 細胞裂解:收集細胞并進行裂解,釋放RNA-蛋白質復合物。在裂解過程中添加蛋白酶抑制劑以防止蛋白質降解。
3. 超聲處理:使用超聲波破壞細胞,獲得更小的染色質片段,這有助于后續步驟中抗體的接觸。
4. 除去細胞碎片:通過離心去除細胞碎片和未裂解的細胞,收集含RNA-蛋白質復合物的上清液。
5. 免疫沉淀:將針對特定RNA結合蛋白(RBP)的抗體加入到上清液中。孵育一段時間,使抗體與目標蛋白充分結合。
6. 捕獲免疫復合物:添加蛋白A或蛋白G結合的磁珠或瓊脂糖珠。孵育使抗體-蛋白質-RNA復合物與珠子結合。
7. 洗滌:多次洗滌珠子以去除未特異性結合的蛋白質和RNA。
8. 洗脫與逆轉交聯:使用適當的緩沖液洗脫免疫復合物。使用蛋白酶K處理樣品以逆轉交聯,釋放RNA。
9. RNA提取與純化:從免疫沉淀樣品中提取RNA,并進行純化。
10. RNA分析:使用qPCR、Northern blot、RNA-Seq等方法分析沉淀的RNA,以確定與目標蛋白相互作用的RNA種類。
免疫沉淀技術ChIP的實驗設計。南京ChIP免疫沉淀磁珠應用
Co-IP的優勢:
1. 生理相關性:Co-IP可以在接近生理條件的條件下捕獲蛋白質相互作用。
2. 特異性:使用特異性抗體可以提高實驗的特異性。
3. 廣泛應用:Co-IP技術適用于多種樣本類型,包括細胞培養、組織樣本等。
Co-IP的局限性:
1. 抗體依賴性:需要高質量的特異性抗體,否則可能得到假陽性或假陰性結果。
2. 非特異性結合:可能存在非特異性結合問題,需要仔細的實驗設計和對照來控制。
3. 技術挑戰:對于低豐度或弱相互作用的蛋白質,Co-IP可能面臨技術挑戰。
北京IP免疫沉淀外包公司免疫沉淀技術IP的原理是什么?
免疫沉淀技術(Immunoprecipitation, IP)的實驗方法通常包括以下步驟:
1. 樣本準備
2. 蛋白質濃度測定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法測定裂解液中蛋白質的濃度。
3. 抗體預處理:如果使用預固定的抗體,需先將抗體固定在固相支持物上,如瓊脂糖珠或磁性微珠。
4. 免疫沉淀反應:將裂解液與特異性抗體(固定或未固定)混合,并在4°C下緩慢搖晃孵育過夜,以允許抗體與目標蛋白質充分結合。
5. 固相支持物的回收:對于未固定的抗體,加入與抗體特異性結合的蛋白A或蛋白G結合的固相支持物。
6. 洗滌:去除未結合的蛋白質和雜質,通常需要多次洗滌固相支持物。
7. 洗脫:使用適當的洗脫緩沖液(如加熱的SDS加載緩沖液或酸性緩沖液)從固相支持物上洗脫免疫復合物。
8. 后續分析:對洗脫的蛋白質進行SDS-PAGE電泳、Western Blot、質譜分析等,以進一步分析目標蛋白質。
免疫沉淀技術(Immunoprecipitation, IP)是一種用于研究蛋白質相互作用、蛋白質復合物組成以及特定蛋白質的表達和純化的實驗技術。
基本原理
免疫沉淀技術基于抗體與特定蛋白質(抗原)之間的特異性相互作用。通過使用針對目標蛋白質的特異性抗體,可以從含有多種蛋白質的復雜樣本中捕獲并富集目標蛋白質。
免疫沉淀技術有多種類型,包括:
1. 個別免疫沉淀法(Individual IP)
2. 免疫共沉淀法(Co-IP)
3. 染色質免疫沉淀法(ChIP)
4. RNA免疫沉淀法(RIP)
近年來,免疫沉淀技術在固相支持物的選擇上有了很大進步。磁性微珠因其操作簡便、快速和自動化程度高而逐漸取代了傳統的瓊脂糖樹脂。
免疫沉淀技術Co-IP的實驗方法。
免疫沉淀技術的實驗設計通常包括以下幾個關鍵步驟:
1. 目標蛋白質的選擇:
2. 抗體的選擇:選擇特異性強、親和力高的抗體來捕獲目標蛋白質
3. 樣本的準備:收集和準備細胞或組織樣本。
4. 蛋白質的裂解和釋放:選擇合適的裂解條件,如pH值、離子強度、去污劑等。
5. 蛋白質濃度的測定:確定裂解液中蛋白質的濃度,以便于后續步驟的標準化。
6. 免疫沉淀的操作:將特異性抗體與裂解液混合,并在適宜的條件下孵育,以形成抗體-抗原復合物。
7. 非特異性結合的減少:通過預純化步驟去除可能的非特異性結合蛋白。
8. 洗滌:多次洗滌以去除未結合的蛋白質和雜質。
9. 目標蛋白質的洗脫:使用適當的緩沖液洗脫抗體-抗原復合物。
10. 后續分析:對洗脫的蛋白質進行進一步分析,如Western Blot.
11. 對照實驗:設計適當的正對照和負對照,以評估實驗的特異性和敏感性。
免疫沉淀選瓊脂糖珠還是磁珠?免疫沉淀外包公司
免疫沉淀和免疫共沉淀的區別?南京ChIP免疫沉淀磁珠應用
免疫沉淀技術RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)的實驗方法基于以下幾個關鍵步驟:
1. 細胞裂解:首先,細胞或組織樣本被裂解,以釋放細胞內的蛋白質和RNA復合物。
2.抗體特異性結合:裂解后的樣本中加入針對特定RNA結合蛋白的抗體。這些抗體能夠特異性地識別并結合到目標蛋白。
3. 免疫復合物形成:抗體與目標蛋白結合后,形成抗體-蛋白質-RNA復合物。
4. 親和介質捕獲:使用蛋白A或蛋白G結合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)來捕獲這些抗體-蛋白質-RNA復合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結合,從而拉下與之結合的復合物。
5. 洗滌:捕獲的復合物被洗滌以去除未特異性結合的蛋白質和RNA。
6. RNA分離和分析:從珠子上洗脫或消化復合物,分離出RNA,并進行進一步的分析,如qPCR、Northern blot或高通量測序(RNA-Seq)。
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